Het is 3 jaar na het originele Battle Royale programma, en overlevenden Shuya Nanahara en Noriko hebben een terroristische groep opgericht die bekend staat als "Wild Seven". Als er op eerste kerstdag een bom ontploft in Tokyo waarbij 8000 doden vallen, worden de “Wild Seven”aangewezen als verantwoordelijken.
Shuya Nanahara stuurt na deze gebeurtenissen een videobericht naar alle wereldleiders met als boodschap “Wij verklaren Oorlog aan alle Volwassenen”
De Japanse regering, wederom wanhopig, creëert vervolgens Het Millenium Anti-Terrorisme Overlevings Programma - beter bekend als BR2.
